¿Quiénes somos? Amaris Consulting es una firma independiente de consultoría tecnológica que ofrece orientación y soluciones a empresas. Con más de 1000 clientes en todo el mundo, hemos implementado soluciones en proyectos importantes durante más de una década, lo cual ha sido posible gracias a un equipo internacional de 7600 personas distribuidas en 5 continentes y más de 60 países. Nuestras soluciones se centran en cuatro líneas comerciales diferentes: Sistema de Información y Digital, Telecomunicaciones, Ciencias de la Vida e Ingeniería. Nos enfocamos en construir y cultivar una comunidad de talentos destacados donde todos nuestros miembros puedan alcanzar su máximo potencial. Amaris es tu trampolín para cruzar ríos de cambio, enfrentar desafíos y lograr con éxito todos tus proyectos. En Amaris, nos esforzamos por ofrecer a nuestros candidatos la mejor experiencia de reclutamiento posible. Nos gusta conocer a nuestros candidatos, desafiarlos y poder brindarles retroalimentación adecuada lo más rápido posible. Así es nuestro proceso de reclutamiento: **Llamada breve:** Nuestro proceso generalmente comienza con una breve conversación virtual o telefónica para conocerte. ¿El objetivo? Conocerte, entender tus motivaciones y asegurarnos de tener el puesto adecuado para ti. Entrevistas (el número promedio de entrevistas es 3; puede variar según el nivel de seniority requerido para el puesto). Durante las entrevistas, conocerás a personas de nuestro equipo: tu gerente directo, por supuesto, pero también otras personas relacionadas con tu futuro rol. Hablaremos detalladamente sobre ti, tu experiencia y habilidades, pero también sobre el puesto y lo que se espera de ti. Por supuesto, también conocerás Amaris: nuestra cultura, nuestros orígenes, nuestros equipos y tus oportunidades de carrera. **Estudio de caso:** Dependiendo del puesto, podríamos pedirte que realices una prueba. Podría ser una simulación de rol, una evaluación técnica, un escenario de resolución de problemas, etc. Como sabes, cada persona es diferente, al igual que cada puesto en una empresa. Por eso debemos adaptarnos, y el proceso puede variar ligeramente en ocasiones. Sin embargo, ten en cuenta que siempre nos ponemos en el lugar del candidato para garantizar que tenga la mejor experiencia posible. ¡Esperamos conocerte! Descripción del puesto Buscamos a un Ingeniero de Pipelines / Bioinformático (4–6 años de experiencia) para liderar el diseño, optimización y operación de pipelines de NGS/ómica para conjuntos de datos a gran escala. En este rol, colaborarás con biólogos, científicos de datos e ingenieros de plataformas para transformar experimentos de investigación en flujos de trabajo robustos y automatizados que funcionen eficientemente en clústeres HPC y/o entornos en la nube. Este puesto es remoto en Canadá o América Latina. Principales responsabilidades Desarrollar y mantener pipelines de producción para genómica, transcriptómica y otros ómicos (por ejemplo, alineación, cuantificación, llamada de variantes, control de calidad, integración de datos). Fortalecer y optimizar código de investigación en flujos de trabajo reproducibles (contenerización, CI/CD, trazabilidad). Optimizar recursos de cómputo y almacenamiento mediante paralelización, procesamiento por lotes y ajuste de costo/rendimiento. **Operar a gran escala en entornos HPC y en la nube:** enviar, monitorear y solucionar incidencias de trabajos, asegurando confiabilidad y rendimiento. Planificar y ejecutar migraciones a la nube y transiciones desde sistemas heredados, incluyendo migración de datos, copias de seguridad y recuperación. Colaborar transversalmente con equipos experimentales y analíticos para definir requisitos, criterios de aceptación y apoyar los resultados del estudio. Garantizar la gobernanza y cumplimiento de datos mediante el mantenimiento de estándares de metadatos y protocolos de seguridad. Diseñar y mantener infraestructura de datos en AWS, desarrollar y optimizar pipelines ETL/ELT, y establecer estándares globales de ingeniería. Requisitos **Formación y experiencia:** Maestría o doctorado en Bioinformática, Biología Computacional, Ciencias de la Computación o campo relacionado. 4–6 años de experiencia práctica diseñando, validando e implementando pipelines de NGS/ómica en producción. Experiencia práctica ejecutando cargas de trabajo en entornos HPC (por ejemplo, SLURM/SGE) y/o plataformas en la nube. **Habilidades técnicas:** Programación sólida en Python y/o R, scripting de shell, Git y Linux. Dominio de herramientas de gestión de flujos de trabajo (Nextflow, Snakemake) y contenerización (Docker). Conocimientos sobre servicios de AWS y arquitecturas nativas de la nube. Valorado, pero no excluyente:** Experiencia con pipelines de transcriptómica de célula única y espacial (por ejemplo, Cell Ranger). **Conocimientos en ingeniería de datos:** modelos de datos, estructuras de almacenamiento en objetos, gestión de metadatos y entornos reproducibles. Experiencia con servicios administrados de procesamiento por lotes/ejecución, Databricks o Spark. Habilidades comunicativas sólidas y capacidad para trabajar estrechamente con equipos de laboratorio y plataformas. Por qué elegirnos Una comunidad internacional que reúne a más de 110 nacionalidades diferentes **Un entorno donde la confianza es fundamental:** El 70 % de nuestros líderes comenzaron sus carreras en niveles iniciales Un sólido sistema de formación con nuestra Academia interna y más de 250 módulos disponibles Un entorno de trabajo dinámico que frecuentemente se reúne para eventos internos (afterworks, actividades de team building, etc.) Amaris Consulting promueve la igualdad de oportunidades. Estamos comprometidos a reunir personas de diversos orígenes y crear un entorno de trabajo inclusivo. En este sentido, damos la bienvenida a solicitudes de todos los candidatos calificados, independientemente de sexo, orientación sexual, raza, etnia, creencias, edad, estado civil, discapacidad u otras características.